hpc集群:用户手册

Nov 7, 2018 15:07 · 192 words · 1 minute read cluster user 11 system Author: qiusb

SGE

1. 任务提交

qsub jobname.sh

提交到指定节点

qsub -q nodename jobname.sh

2. 任务查询

查看用户任务

qstat

查看所有任务

qstat -u “*”

任务状态

qw 等待

Eqw 任务出差

r 运行中

dr 节点挂了,删除任务出现此状态(节点重启,或者强制删除任务)

3. 任务删除

qdel numbe_job

qdel -f numbe_job     #强制删除

4. 查看主机状态和负荷

qhost

5. 修改用户计算资源限制

su
qconf -mrqs

任务脚本参考

job.sh

#! /bin/sh              
#$ -S /bin/sh           
#$ -cwd                 
#$ -V                   
#$ -N jobname           
#$ -pe orte 20         
#$ -j y                 
     
mpirun -np ${NSLOTS} vasp5.4.4-std                

orte 后是核数,11里面是每个计算节点20核,所以使用20的整数倍

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