使用slurm在集群上使用julia
Apr 1, 2019 00:00 · 524 words · 2 minute read Author: Huang weijie
以任务的方式提交julia任务(recommoned)
slurm脚本模板为job.sh：
#!/bin/bash
#SBATCH -J long-time
#SBATCH -p sonmi_2 -N 1 -n 40
module load julia/1.8.5
echo 'This program is running at' `hostname`
julia -t 40 ./Operator-j-BLP-v2-applycutoff=1E-6-2023-3-15-V=3-longTime.jl
~
参数julia -t后面的数字可以julia使用的线程数目（并不是越多越快，具体原因可以参考ITensor文档里面的multithreading一节），数字后紧跟所要运行的.jl文件的文件名！！！注意和matlab不一样，julia要写后缀，否则会出错！！！。
将脚本与要执行的.jl文件放在相同文件夹下，运行sbatch ./job.sh即可。
在管理节点使用交互式的模式进行julia运算(only recommend for test)
Step 1
首先使用module load julia/1.8.5
此时，会进入加载julia可执行模块的到路径。
Step 2
julia -t -6
打开repl 模式的julia，可以在这里查看库函数的版本，也可以运行简单的测试程序。
julia 程序输出的slurm不会及时更新问题
建议在运行时间比较长的脚本里面使用println来输出一些量来反馈程序运行进度。
因为在大型运算的脚本中，println的结果会被buffering，也就是被缓存，然后程序结束的时候一次性放出来，所以需要使用flush(stdout)，强制julia和repl交流，实时打印出缓存中的内容，然后清空缓存。